DataFrame 피봇과 그룹

2020년 10월 18일
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피봇테이블

피봇테이블(pivot table)이란 데이터 열 중에서 두개의 열을 각각 행 인덱스, 열 인덱스로 사용하여 데이터를 조회하여 펼쳐놓은 것을 말한다.

Pandas는 피봇테이블을 만들기 위한 pivot 매서드를 제공한다. 첫번째 인수로는 행 인덱스로 사용할 열 이름, 두뻔째 인수로는 열 인덱스로 사용할 열 이름, 그리고 마지막으로 데이터로 사용할 열 이름을 넣는다.

Pandas는 지정된 두 열을 각각 행 인덱스와 열 인덱스로 바꾼 후 행 인덱스 라벨 값이 첫번째 키의 값과 같고 열 인덱스의 라벨 값이 두번째 키의 값과 같은 데이터를 찾아서 해당 칸에 넣는다. 만약 주어진 데이터가 존재하지 않으면 해당 칸에 NaN 값을 넣는다.

다음 데이터는 각 도시의 연도별 인구를 나타낸 것이다.

import pandas as pd
data = {
    "도시": ["서울", "서울", "서울", "부산", "부산", "부산", "인천", "인천"],
    "연도": ["2015", "2010", "2005", "2015", "2010", "2005", "2015", "2010"],
    "인구": [9904312, 9631482, 9762546, 3448737, 3393191, 3512547, 2890451, 263203],
    "지역": ["수도권", "수도권", "수도권", "경상권", "경상권", "경상권", "수도권", "수도권"]
}
columns = ["도시", "연도", "인구", "지역"]
df1 = pd.DataFrame(data, columns=columns)
df1
도시연도인구지역
0서울20159904312수도권
1서울20109631482수도권
2서울20059762546수도권
3부산20153448737경상권
4부산20103393191경상권
5부산20053512547경상권
6인천20152890451수도권
7인천2010263203수도권

이 데이터를 도시 이름이 열 인덱스가 되고 연도가 행 인덱스가 되어 행과 열 인덱스만 보면 어떤 도시의 어떤 시점의 인구를 쉽게 알수 있도록 피봇테이블로 만들어 보자. pivot 명령으로 사용하고 행 인덱스 인수로는 도시, 열 인덱스 인수로는 연도, 데이터 이름으로 인구를 입력하면 된다.

df1.pivot("도시", "연도", "인구")
도시200520102015
부산3512547.03393191.03448737.0
서울9762546.09631482.09904312.0
인천NaN263203.02890451.0

이 피봇테이블의 값 3512547은 "도시"가 부산이고 "연도"가 2005년인 데이터를 "인구"열에서 찾은 값이다. 2005년 인천의 인구는 데이터에 없기 때문에 NaN으로 표시된다.

피봇테이블은 다음과 같이 set_index 명령과 unstack 명령을 사용하서 만들 수도 있다.

df1.set_index(["도시","연도"])[["인구"]].unstack()
도시200520102015
부산3512547.03393191.03448737.0
서울9762546.09631482.09904312.0
인천NaN263203.02890451.0

행 인덱스나 열 인덱스를 리스트로 주는 경우에는 다중 인덱스 피봇 테이블을 생성한다.

df1.pivot(["지역","도시"], "연도", "인구")
연도200520102015
지역도시
경상권부산3512547.03393191.03448737.0
수도권서울9762546.09631482.09904312.0
인천NaN263203.02890451.0

행 인덱스와 열 인덱스는 데이터를 찾는 키(key)의 역할을 한다. 따라서 키 값으로 데이터가 단 하나만 찾아져야 한다. 만약 행 인덱스와 열 인덱스 조건을 만족하는 데이터가 2개 이상인 경우에는 에러가 발생한다. 예를 들어 위 데이터프레임에서 ("지역", "연도")를 키로 하면 ("수도권", "2015")에 해당하는 값이 두개 이상이므로 다음과 같이 에러가 발생한다.

try:
    df1.pivot("지역", "연도", "인구")
except ValueError as e:
    print("ValueError:", e)

ValueError: Index contains duplicate entries, cannot reshape

그룹분석

만약 키가 지정하는 조건에 맞는 데이터가 하나 이상이라서 데이터 그룹을 이루는 경우에는 그룹의 특성을 보여주는 그룹분석(group analysis)을 해야 한다.

그룹분석은 피봇테이블과 달리 키에 의해서 결정되는 데이터가 여러개가 있을 경우 미리 지정한 연선을 통해 그 그룹 데이터의 대표값을 계산한다. Pandas에서는 groupby 매서드를 사용하여 다음처럼 그룹분석을 한다.

> 1. 분석하고자 하는 시리즈나 데이터프레임에 groupby 매서드를 호출하여 그룹화를 한다.
> 2. 그룹 객체에 대해 그룹연산을 수행한다.

그룹연산 매서드

groupby 결과, 즉 GroupBy 클래스 객체의 뒤에 붙일 수 있는 그룹연산 매서드는 다양하다. 다음은 자주 사용되는 그룹연산 매서드들이다.

  • size, count : 그룹 데이터의 개수
  • mean, median, min, max : 그룹 데이터의 평균, 중앙값, 최소, 최대
  • sum, prod, std, var, quantile : 그룹 데이터의 합계, 곱, 표준편차, 분산, 사분위수
  • first, last : 그룹 데이터중 가장 첫번째 데이터와 가장 나중 데이터와

이 외에도 많이 사용되는 것으로는 다음과 같은 그룹 연산이 있다.

  • agg, aggregate
    • 만약 원하는 구릅연산이 없는 경우 함수를 만들고 이 함수를 agg에 전달한다.
    • 또는 여러가지 그룹연산을 동시에 하고 싶은 경우 함수 이름 문자열의 리스트를 전달한다.
  • describe
    • 하나의 그룹 대표값이 아니라 여러개의 값을 데이터프레임으로 구한다.
  • apply
    • describe 처럼 하나의 대표값이 아닌 데이터프레임을 출력하지만 원하는 그룹연산이 없는 경우에 사용한다.
  • transform
    • 그룹에 대한 대표값을 만드는 것이 아니라 그룹별 계산을 통해 데이터 자체를 변형한다.

예를 들어 다음과 같은 데이터가 있을 때 key1의 값(A 또는 B)에 따른 data1의 평균은 어떻게 구할까?

import numpy as np
np.random.seed(0)
df2 = pd.DataFrame({
    'key1': ['A', 'A', 'B', 'B', 'A'],
    'key2': ['one', 'two', 'one', 'two', 'one'],
    'data1': [1, 2, 3, 4, 5],
    'data2': [10, 20, 30, 40, 50]
})
df2
key1key2data1data2
0Aone110
1Atwo220
2Bone330
3Btwo440
4Aone550

groupby 명령을 사용하여 그룹 A와 그룹 B로 구분한 그룹 데이터를 만든다.

groups = df2.groupby(df2.key1)
groups

<pandas.core.groupby.generic.dataframegroupby 0x000002b5de8ddac0="" at="" object="">

GroupBy 클래스 객체에는 각 그룹 데이터의 인덱스를 저장한 groups 속성이 있다.

groups.groups
 
{'A': [0, 1, 4], 'B': [2, 3]}

A그룹과 B그룹 데이터의 합계를 구하기 위해 sum이라는 그룹연산을 한다.

groups.sum()
data1data2
key1
A880
B770

GroupBy클래스 객체를 명시적으로 얻을 필요가 없다면 groupby 매서드와 그룹연산 메서드를 연속으로 호출한다. 다음 예제는 열 data1에 대해서만 그룹연산을 하는 코드 이다.

df2.data1.groupby(df2.key1).sum()

key1
A 8
B 7
Name: data1, dtype: int64

데이터를 그룹으로 나눈 GroupBy 클래스 객체 또는 그룹분석한 결과에서 data1만 뽑아도 된다.

df2.groupby(df2.key1)["data1"].sum() # 'GroupBy' 클래스 객체에서 data1만 선택하여 분석

key1
A 8
B 7
Name: data1, dtype: int64

df2.groupby(df2.key1).sum()["data1"]  # 전체 데이터를 분석한 후 data1만 선택한 경우

key1
A 8
B 7
Name: data1, dtype: int64

이번에는 복합 키 (key1, key2) 값에 따른 data1의 합계를 구하자. 분석하고자 하는 키가 복수이면 리스트를 사용한다.

df2.data1.groupby([df2.key1, df2.key2]).sum()

key1 key2
A one 6
two 2
B one 3
two 4
Name: data1, dtype: int64

이 결과를 unstack 명령으로 피봇 테이블 행태로 만들수도 있다.

df2.data1.groupby([df2['key1'], df2['key2']]).sum().unstack('key2')
key2onetwo
key1
A62
B34

그룹분석 기능을 사용하면 위의 인구 데이터로부터 지역별 합계를 구할 수도 있다.

df1
도시연도인구지역
0서울20159904312수도권
1서울20109631482수도권
2서울20059762546수도권
3부산20153448737경상권
4부산20103393191경상권
5부산20053512547경상권
6인천20152890451수도권
7인천2010263203수도권
df1['인구'].groupby([df1['지역'], df1['연도']]).sum().unstack('연도')
연도200520102015
지역
경상권351254733931913448737
수도권9762546989468512794763

다음 데이터는 150 송이의 붓꽃(iris)에 대해 붓꽃 종(species)별로 꽃받침길이(sepal_langth), 꽃받침폭(sepal_width), 꽃잎길이(tetal_length), 꽃잎폭(petal_width)을 측정한 데이터이다.

import seaborn as sns
iris = sns.load_dataset("iris")
iris
sepal_lengthsepal_widthpetal_lengthpetal_widthspecies
05.13.51.40.2setosa
14.93.01.40.2setosa
24.73.21.30.2setosa
34.63.11.50.2setosa
45.03.61.40.2setosa
..................
1456.73.05.22.3virginica
1466.32.55.01.9virginica
1476.53.05.22.0virginica
1486.23.45.42.3virginica
1495.93.05.11.8virginica

각 붓꽃 종별로 가장 큰 값과 가장 작은 값의 비율을 구해보자. 이러한 계산을 하는 그룹연산 매서드는 없으므로 직접 함수로 만들고 agg 매서드를 이용해야 한다.

def peak_to_peak_ratio(x):
    return x.max() / x.min()
 
iris.groupby(iris.species).agg(peak_to_peak_ratio)
sepal_lengthsepal_widthpetal_lengthpetal_width
species
setosa1.3488371.9130431.9000006.000000
versicolor1.4285711.7000001.7000001.800000
virginica1.6122451.7272731.5333331.785714

describe 매서드를 사용하면 다양한 기술 통계(descriptive statistics)값을 한 번에 구한다. 그룹별로 하나의 스칼라 값이 아니라 하나의 데이터프레임이 생성된다는 점에 주의하자.

iris.groupby(iris.species).describe().T
speciessetosaversicolorvirginica
sepal_lengthcount50.00000050.00000050.000000
mean5.0060005.9360006.588000
std0.3524900.5161710.635880
min4.3000004.9000004.900000
25%4.8000005.6000006.225000
50%5.0000005.9000006.500000
75%5.2000006.3000006.900000
max5.8000007.0000007.900000
sepal_widthcount50.00000050.00000050.000000
mean3.4280002.7700002.974000
std0.3790640.3137980.322497
min2.3000002.0000002.200000
25%3.2000002.5250002.800000
50%3.4000002.8000003.000000
75%3.6750003.0000003.175000
max4.4000003.4000003.800000
petal_lengthcount50.00000050.00000050.000000
mean1.4620004.2600005.552000
std0.1736640.4699110.551895
min1.0000003.0000004.500000
25%1.4000004.0000005.100000
50%1.5000004.3500005.550000
75%1.5750004.6000005.875000
max1.9000005.1000006.900000
petal_widthcount50.00000050.00000050.000000
mean0.2460001.3260002.026000
std0.1053860.1977530.274650
min0.1000001.0000001.400000
25%0.2000001.2000001.800000
50%0.2000001.3000002.000000
75%0.3000001.5000002.300000
max0.6000001.8000002.500000

apply 매서드를 사용하면 describe 매서드처럼 하나의 그룹에 대해 하나의 대표값(스칼라 값)을 구하는게 아니라 데이터프레임을 만들 수 있다. 예를 들어 다음처럼 각 붓꽃 종별로 가장 꽃잎길이(petal length)가 큰 3개의 데이터를 뽑아낼 수도 있다.

def top3_petal_length(df):
    return df.sort_values(by="petal_length", ascending=False)[:3]
 
iris.groupby(iris.species).apply(top3_petal_length)
sepal_lengthsepal_widthpetal_lengthpetal_widthspecies
species
setosa244.83.41.90.2setosa
445.13.81.90.4setosa
235.13.31.70.5setosa
versicolor836.02.75.11.6versicolor
776.73.05.01.7versicolor
726.32.54.91.5versicolor
virginica1187.72.66.92.3virginica
1177.73.86.72.2virginica
1227.72.86.72.0virginica

transform 매서드는 그룹별 대표값을 만드는 것이 아니라 그룹별 계산을 통해 데이터프레임 자체를 변화시킨다. 따라서 만들어진 데이터프레임의 크기는 원래 데이터프레임과 같다. 예를 들어 다음처럼 각 붓꽃 꽃잎길이가 해당 종 내에서 대/중/소 어느 것에 해당되는지에 대한 데이터프레임을 만들 수도 있다.

def q3cut(s):
    return pd.qcut(s, 3, labels=["소", "중", "대"]).astype(str)
 
iris["petal_length_class"] = iris.groupby(iris.species).petal_length.transform(q3cut)
iris[["petal_length", "petal_length_class"]].tail(10)
petal_lengthpetal_length_class
1405.6
1415.1
1425.1
1435.9
1445.7
1455.2
1465.0
1475.2
1485.4
1495.1

pivot_table

Pandas는 pivot 명령과 groupby 명령의 중간 성격을 가지는 pivot_table 명령도 제공한다.

pivot_table 명령은 groupby 명령처럼 그룹분석을 하지만 최종적으로는 pivot 명령처럼 피봇테이블을 만든다. 즉 groupby 명령의 결과에 unstack을 자동 적용하여 2차원적인 형태로 변형한다. 사용 방법은 다음과 같다.

  • pivot_table(data, values=None, index=None, columns=None, aggfunc='mean', fill_value=None, margins=False, margins_name='All')
  • data: 분석할 데이터프레임 (메서드일 때는 필요하지 않음)
  • values: 분석할 데이터프레임에서 분석할 열
  • index: 행 인덱스로 들어갈 키 열 또는 키 열의 리스트
  • columns: 열 인덱스로 들어갈 키 열 또는 키 열의 리스트
  • aggfunc: 분석 메서드
  • fill_value: NaN 대체 값
  • margins: 모든 데이터를 분석한 결과를 오른쪽과 아래에 붙일지 여부
  • margins_name: 마진 열(행)의 이름

만약 조건에 따른 데이터가 유일하게 선택되지 않으면 그룹연산을 하며 이 때 aggfunc 인수로 정의된 함수를 수행하여 대표값을 계산한다.

pivot_table를 메서드로 사용할 때는 객체 자체가 데이터가 되므로 data 인수가 필요하지 않다.

예를 들어 위에서 만들었던 피봇테이블은 pivot_table 명령으로 다음과 같이 만들 수도 있다. 인수의 순서에 주의해야 한다.

df1.pivot_table("인구", "도시", "연도")
연도200520102015
도시
부산3512547.03393191.03448737.0
서울9762546.09631482.09904312.0
인천NaN263203.02890451.0

margins=True 인수를 주면 aggfunc로 주어진 분석 방법을 해당 열의 모든 데이터, 해당 행의 모든 데이터 그리고 전체 데이터에 대해 적용한 결과를 같이 보여준다. aggfunc가 주어지지 않았으면 평균을 계산한다.

df1.pivot_table("인구", "도시", "연도", margins=True, margins_name="평균")
연도200520102015평균
도시
부산3512547.03393191.03448737.03.451492e+06
서울9762546.09631482.09904312.09.766113e+06
인천NaN263203.02890451.01.576827e+06
평균6637546.54429292.05414500.05.350809e+06

이 결과에서 가장 오른쪽 합계 열의 첫번째 값 3451492은 모든 부산 인구 데이터의 평균, 두번째 값 9766113은 모든 서울 인구 데이터의 평균이다. 가장 아래의 합계 행의 첫번째 값은 2005년 데이터의 평균값, 두번째 값은 2010년 데이터의 평균값이다. 가장 오른쪽 아래의 값 5350809는 전체 데이터의 평균값이다. 다음 계산을 통해 이를 확인할 수 있다.

df1["인구"].mean()

5350808.625

행 인덱스나 열 인덱스에 리스트를 넣으면 다중 인덱스 테이블을 만든다.

df1.pivot_table("인구", index=["연도", "도시"])
인구
연도도시
2005부산3512547
서울9762546
2010부산3393191
서울9631482
인천263203
2015부산3448737
서울9904312
인천2890451

식당에서 식사 후 내는 팁(tip)과 관련된 데이터를 이용하여 좀더 구체적으로 그룹분석 방법을 살펴본다. 우선 Seaborn 패키지에 설치된 샘플 데이터를 로드한다. 이 데이터프레임에서 각각의 컬럼은 다음을 뜻한다.

  • total_bill: 식사대금
  • tip: 팁
  • sex: 성별
  • smoker: 흡연/금연 여부
  • day: 요일
  • time: 시간
  • size: 인원
tips = sns.load_dataset('tips')
tips.tail()
total_billtipsexsmokerdaytimesize
23929.035.92MaleNoSatDinner3
24027.182.00FemaleYesSatDinner2
24122.672.00MaleYesSatDinner2
24217.821.75MaleNoSatDinner2
24318.783.00FemaleNoThurDinner2

분석의 목표는 식사 대금 대비 팁의 비율이 어떤 경우에 가장 높아지지는 찾는 것이다. 우선 식사대금와 팁의 비율을 나타내는 tip_pct를 추가하자.

tips["tip_pct"] = tips["tip"] / tips["total_bill"]
tips.tail()
total_billtipsexsmokerdaytimesizetip_pct
23929.035.92MaleNoSatDinner30.203927
24027.182.00FemaleYesSatDinner20.073584
24122.672.00MaleYesSatDinner20.088222
24217.821.75MaleNoSatDinner20.098204
24318.783.00FemaleNoThurDinner20.159744

다음으로 각 열의 데이터에 대해 간단히 분포를 알아본다.

tips.describe()
total_billtipsizetip_pct
count244.000000244.000000244.000000244.000000
mean19.7859432.9982792.5696720.160803
std8.9024121.3836380.9511000.061072
min3.0700001.0000001.0000000.035638
25%13.3475002.0000002.0000000.129127
50%17.7950002.9000002.0000000.154770
75%24.1275003.5625003.0000000.191475
max50.81000010.0000006.0000000.710345

우선 성별로 나누어 데이터 갯수를 세어보자

tips.groupby('sex').count()
total_billtipsmokerdaytimesizetip_pct
sex
Male157157157157157157157
Female87878787878787

데이터 갯수의 경우 NaN 데이터가 없다면 모두 같은 값이 나올 것이다. 이 때는 size 명령을 사용하면 더 간단히 표시된다. size 명령은 NaN이 있어도 상관하지 않는다.

tips.groupby('sex').size()

sex
Male 157
Female 87
dtype: int64

이번에는 성별과 흡연유무로 나누어 데이터 갯수를 알아보자.

tips.groupby(["sex", "smoker"]).size()

sex smoker
Male Yes 60
No 97
Female Yes 33
No 54
dtype: int64

좀더 보기 좋게 피봇 테이블 형태로 바꿀 수도 있다.

tips.pivot_table("tip_pct", "sex", "smoker", aggfunc="count", margins=True)
smokerYesNoAll
sex
Male6097157
Female335487
All93151244

이제 성별과 흡연 여부에 따른 평균 팁 비율을 살펴보자

tips.groupby("sex")[["tip_pct"]].mean()
tip_pct
sex
Male0.157651
Female0.166491
tips.groupby("smoker")[["tip_pct"]].mean()
 
tip_pct
smoker
Yes0.163196
No0.159328

pivot_table 명령을 사용할 수도 있다.

tips.pivot_table("tip_pct", "sex")
tip_pct
sex
Male0.157651
Female0.166491
tips.pivot_table("tip_pct", ["sex", "smoker"])
tip_pct
sexsmoker
MaleYes0.152771
No0.160669
FemaleYes0.182150
No0.156921
tips.pivot_table("tip_pct", "sex", "smoker")
smokerYesNo
sex
Male0.1527710.160669
Female0.1821500.156921

여성 혹은 흡연자의 팁 비율이 높은 것을 볼 수 있다. 하지만 이 데이터에는 평균을 제외한 분산(variance) 등의 다른 통계값이 없으므로 describe 명령으로 여러가지 통계값을 한 번에 알아본다.

tips.groupby("sex")[["tip_pct"]].describe()
tip_pct
count
sex
Male157.0
Female87.0
tips.groupby("smoker")[["tip_pct"]].describe()
tip_pct
count
smoker
Yes93.0
No151.0
tips.groupby(["sex", "smoker"])[["tip_pct"]].describe()
tip_pct
count
sexsmoker
MaleYes60.0
No97.00.160669
FemaleYes33.0
No54.00.156921

이번에는 각 그룹에서 가장 많은 팁과 가장 적은 팁의 차이를 알아보자. 이 계산을 해 줄 수 있는 그룹연산 함수가 없으므로 함수를 직접 만들고 agg메서드를 사용한다.

def peak_to_peak(x):
    return x.max() - x.min()
 
tips.groupby(["sex", "smoker"])[["tip"]].agg(peak_to_peak)
tip
sexsmoker
MaleYes9.00
No7.75
FemaleYes5.50
No4.20

만약 여러가지 그룹연산을 동시에 하고 싶다면 다음과 같이 리스트를 이용한다.

tips.groupby(["sex", "smoker"]).agg(["mean", peak_to_peak])[["total_bill"]]
total_bill
mean
sexsmoker
MaleYes22.284500
No19.79123740.82
FemaleYes17.977879
No18.10518528.58

만약 데이터 열마다 다른 연산을 하고 싶다면 열 라벨과 연산 이름(또는 함수)를 딕셔너리로 넣는다.

tips.groupby(["sex", "smoker"]).agg({'tip_pct': 'mean', 'total_bill':peak_to_peak})
tip_pcttotal_bill
sexsmoker
MaleYes0.15277143.56
No0.16066940.82
FemaleYes0.18215041.23
No0.15692128.58

다음은 pivot_table 명령으로 더 복잡한 분석을 한 예이다.

tips.pivot_table(['tip_pct', 'size'], ['sex', 'day'], 'smoker')
sizetip_pct
smokerYesNo
sexday
MaleThur2.3000002.500000
Fri2.1250002.0000000.144730
Sat2.6296302.6562500.139067
Sun2.6000002.8837210.173964
FemaleThur2.4285712.480000
Fri2.0000002.5000000.209129
Sat2.2000002.3076920.163817
Sun2.5000003.0714290.237075
tips.pivot_table('size', ['time', 'sex', 'smoker'], 'day', aggfunc='sum', fill_value=0)
dayThurFriSatSun
timesexsmoker
LunchMaleYes23500
No50000
FemaleYes17600
No60300
DinnerMaleYes0127139
No0485124
FemaleYes083310
No223043

피봇테이블과 그룹연산에 대해 알아 보았다. 분석 연습을 해보기 위해 자주 사용되는 타이타닉 승객데이터를 이용해서 연습 해보면 좋을 것 같다.

titanic = sns.load_dataset("titanic")

출처 : 데이터사이언스 스쿨(http://datascienceschool.net)